一、糞污全量收集還田利用模式
對養殖場產生的糞便、尿和污水集中收集，全部進入氧化塘貯存，氧化塘分為敞開式和覆膜式兩類，糞污通過氧化塘貯存進行無害化處理，在施肥季節進行農田利用。
主要優點：糞污收集、處理、貯存設施建設成本低，處理利用費用也較低;糞便和污水全量收集，養分利用率高。
主要不足：糞污貯存周期一般要達到半年以上，需要足夠的土地建設氧化塘貯存設施;施肥期較集中，需配套專業化的攪拌設備、施肥機械、農田施用管網等;糞污長距離運輸費用高，只能在一定范圍內施用。
適用范圍：適用于豬場水泡糞工藝或奶牛場的自動刮糞回沖工藝，糞污的總固體含量小于15%;需要與糞污養分量相配套的農田。
二、糞污專業化能源利用模式
以專業生產可再生能源為主要目的，依托專門的畜禽糞污處理企業，收集周邊養殖場糞便和污水，投資建設大型沼氣工程，進行高濃度厭氧發酵，沼氣發電上網或提純生物天然氣，沼渣生產有機肥農田利用，沼液農田利用或深度處理達標排放。
主要優點：對養殖場的糞便和污水集中統一處理，減少小規模養殖場糞污處理設施的投資;專業化運行，能源化利用效率高。
主要不足：一次性投資高;能源產品利用難度大;沼液產生量大集中，處理成本較高，需配套后續處理利用工藝。
適用范圍：適用于大型規模養殖場或養殖密集區，具備沼氣發電上網或生物天然氣進入管網條件，需要地方政府配套政策予以保障。
三、固體糞便堆肥利用模式
以生豬、肉牛、蛋雞、肉雞和羊規模養殖場的固體糞便為主，經好氧堆肥無害化處理后，就地農田利用或生產有機肥。
主要優點：好氧發酵溫度高，糞便無害化處理較徹底，發酵周期短;堆肥處理提高糞便的附加值。
主要不足：好氧堆肥過程易產生大量的臭氣。
適用范圍：適用于只有固體糞便、無污水產生的規模化肉雞、蛋雞或羊場等。
四、糞便墊料回用模式
基于奶牛糞便纖維素含量高、質地松軟的特點，將奶牛糞污固液分離后，固體糞便進行好氧發酵無害化處理后回用作為牛床墊料，污水貯存后作為肥料進行農田利用。
主要優點：牛糞替代沙子和土作為墊料，減少糞污后續處理難度。
主要不足：作為墊料如無害化處理不徹底，可能存在一定的生物安全風險。
適用范圍：適用于規模奶牛場。
五、異位發酵床模式
在傳統發酵床養殖基礎上進行改進，墊料不直接與生豬接觸，豬舍免沖洗，糞便和尿液通過漏縫地板進入下層墊料或轉移到舍外鋪設墊料的發酵槽中，進行糞便、尿液的發酵分解和無害化處理，經過一段時間后可直接作為有機肥料進行農田利用。
主要優點：飼養過程不產生污水，處理成本低。
主要不足：大面積推廣墊料收購難;糞便和尿液混合含水量高，發酵分解時間長，寒冷地區使用受限;高架發酵床豬舍建設成本較高。
適用范圍：主要適用南方水網地區，周圍農田受限的生豬養殖場，其中舍外發酵床適用于年出欄1000頭-2000頭的養殖場，高架發酵床適用于規模較大的養殖場。
六、污水肥料化利用模式
養殖場產生的污水經厭氧發酵或氧化塘處理儲存后，在農田需肥和灌溉期間，將無害化處理的污水與灌溉用水按照一定比例混合，進行水肥一體化施用，固體糞便進行堆肥發酵就近肥料化利用或委托他人進行集中處理。
主要優點：污水進行厭氧發酵或氧化塘無害化處理后，為農田提供有機肥水資源，解決污水處理壓力。
主要不足：要有一定容積的貯存設施，周邊配套一定農田面積;需配套建設糞水輸送管網或購置糞水運輸車輛。
適用范圍：適用于周圍配套有一定面積農田的規模豬場或奶牛場，在南方宜使用厭氧發酵生產沼氣等無害化處理;在北方宜直接使用氧化塘貯存，在農田作物灌溉施肥期間進行水肥一體化施用。
七、污水達標排放模式
養殖場產生的污水進行厭氧發酵+好氧處理等組合工藝進行深度處理，污水達到《畜禽養殖業污染物排放標準》(GB18596-2001，其中COD低于400mg/L，NH3-N低于80mg/L，TP低于8mg/L)或地方標準后直接排放，固體糞便進行堆肥發酵就近肥料化利用或委托他人進行集中處理。
主要優點：污水深度處理后，實現達標排放;不需要建設大型污水貯存池，可減少糞污貯存設施的用地。
主要不足：污水處理成本高，大多養殖場難承受。
適用范圍：適用于養殖場周圍沒有配套農田的規模化豬場或奶牛場。
