1、利用微生態提高飼料消化吸收率
不同的菌種在不同過程中會產生不同的酶，在酶的催化作用下可將動物難以消化吸收的粗纖維、粗蛋白、淀粉、果膠等物質降解成易消化吸收的葡萄糖、氨基酸、寡糖、多肽等小分子，從而改變原料的物理、化學性質，使飼料變軟變香，提高適口性，增加其消化吸收率。
2、利用微生物代謝產物提高動物腸道和機體健康
微生物的生長代謝產生的有機酸、維生素和生物酶，促進了腸道的消化吸收和蠕動。微生物的正?；顒邮潜ＷC動物消化和健康基本條件。
提高了飼料營養水平
1.1 利用微生物的作用將飼料中動物不易消化吸收的物質如粗纖維，果膠等降解轉化為易于動物消化吸收的小分子物質。
1.2 利用微生物中乳酸菌、酵母菌、脂肪菌等其它益生菌，將飼料中各種成份進一步合成為氨基酸、蛋白質、維生素、有機酸。
1.3 利用微生物生長繁殖快、增殖率高，代謝能力強的特性，產生大量菌體及代謝產物。
微生物的菌體營養非常豐富，微生物細胞與其他生物細胞化學組成沒有本質上的差異。在細胞的干物質中有蛋白質、碳水化合物、脂類和礦物質等。蛋白質成分包括了動物所必需的各種氨基酸。微生物的代謝產物為蛋白質、脂類、酶、多糖、核酸等。
2提高了動物自身免疫力
利用有益提高健康水平的假說是梅切尼科夫博士提出的(1907年諾貝爾將獲得者)。動物免疫力提高的理論來源于腸道生態平衡研究，其論點主要有以下幾方面：
2.1 生態平衡論
動物體內寄居著大量的微生物，菌與菌之間相互制約、相互影響、相對平衡。在和平共處的條件下，各益生菌群廣泛布于腸粘膜表層，形成生物屏障，通過占位性保護即競爭粘膜位點排斥病原微生物，或外來致病菌的定植、占位、繁殖。同時在占位點的代謝產物，如乳酸、乙酸、丙酸及細菌等新型物質又可以阻止或殺滅病原微生物。
動物每天都在吃進大量的食物，有大量的微生物會隨食物一同進入腸道內，而自然界中存在的微生物絕大部分對動物是有害的(主要是一些腐敗菌)。菌群與動物和平，菌群與菌群的平衡，會隨動物食入外來菌的數量及菌種與外來菌的戰斗，每時每刻都在進行，量到質的變化也會表現在消化率的變化上。我們有時看到動物排出大量未消化的物質就是菌群失調引起消化不良的結果。如有害菌群在腸道內占具優勢時，就會大量搶占粘膜位點，各種毒素就會通過腸壁向腸外組織轉移，向動物發難引起動物各種疾病。為此需要大量食入新型微生物(包括其發酵物)以補充動物體內的益生菌群，代謝物質、有機酸等，抵消來自自然界的有害菌對動物的影響，使菌群保持相對平衡。
2.2 免疫屏障
益生菌在腸道中占優勢時，會促進動物腸粘膜分泌大量的免疫球蛋白，雙歧桿菌含有較高的脂壁酸及肽聚糖類，能促進干細胞的功能。乳酸菌所產生的有機酸(主要是乙酸和乳酸)可幫助動物延長免疫系統的活動能力。大量食入新型微生物發酵飼料的動物，粘膜基底層淋巴細胞、巨噬細胞吞噬功能提高。
3提高了畜禽產品質量
畜禽養殖工業化的發展，疾病的預防要求越來越嚴，疾病的種類越來越多，市場競爭越來越激烈，因而在養殖業大量使用抗生素、激素，以保證養殖動物健康及高產出，已成為使用抗生素、激素，以保證養殖動物健康及高產出，已成為重要手段。微生態就是通過扶植正常微生物菌群，提高腸道有益微生物的比例，抑制有害微生物的繁殖，調整生理平衡，發揮生物拮抗作用，從而達到降低畜禽的發病率、防病治病，促進生長。
4減少了藥物殘留
益生菌群如乳酸桿菌、雙歧桿菌可以促進宿主腸壁組織結構的發育，分解抗營養因子，增加營養物質的消化利用率，通過營養與空間的競爭，形成優勢菌群抑制有害菌的繁殖與生長。利用微生物中的益生菌群提高動物健康水平、防治畜禽疾病、減少藥物殘留已經成為目前飼料工業、養殖業及食品工業最熱門的話題。
5改善了飼養環境
大量的養殖經驗證明，喂益益生菌的養殖場，糞便的惡臭和氨氣都遠遠低于未使用發酵飼料的場地，同時排出體外的糞便也存在優勢。微生態內含有多種益生菌和微量元素，清潔動物的腸道，減少氨、胺類、吲哚、糞臭素、亞硝酸等有毒化合物，使空氣質量大大的提高，起到凈化飼養環境的作用。大大減少了氨的殘留量，從而減少了惡臭，改善了養殖環境，降低了呼吸道疾病的發生幾率。微生態益生菌：讓養殖環境更和諧，讓資源更有效、讓食品更安全、讓動物更健康。
